Чтобы зашифровать файл в linux можно воспользоваться командой gpg:
gpg -c myfile.txt
...дваджды ввести пароль, и после этого в текущем каталоге появится файл myfile.txt.gpg
Затем его уже можно отправлять куда следует.
На target-машине расшифровываем следующим образом:
gpg myfile.txt.gpg
Рядом с зашифрованным файлом, в каталоге появится myfile.txt
Источник: https://www.cyberciti.biz/tips/linux-how-to-encrypt-and-decrypt-files-with-a-password.html